癌症免疫疗法可能会从一个意想不到的方向得到推动：驻扎在肿瘤细胞内的细菌。在一项新研究中，来自以色列魏茨曼科学研究所的研究人员及其合作者发现，免疫系统可以“看到”这些细菌，并表明可以利用它们引发针对肿瘤的免疫反应。该研究还可能有助于阐明免疫疗法与肠道微生物组之间的联系，解释了之前研究的结果，即肠道微生物组影响免疫疗法的成功。相关研究结果于2021年3月17日在线发表在Nature期刊上，论文标题为“Identification of bacteria-derived HLA-bound peptides in melanoma”。

图片来自Nature, 2021, doi:10.1038/s41586-021-03368-8

过去十几年的免疫疗法极大地提高了某些癌症的康复率，尤其是恶性黑色素瘤；但在黑色素瘤中，免疫疗法仍然只对40%左右的病例有效。魏茨曼科学研究所分子细胞生物学系的Yardena Samuels教授研究了分子“标志物”---细胞表面的蛋白片段，或者说肽，它们可将癌细胞标记为外来的，因此可能成为免疫疗法的潜在新靶点。在这项新的研究中，她和同事们将寻找新的癌症标志物的范围扩大到了那些已知的定植在肿瘤中的细菌。

通过使用Ravid Straussman博士开发的方法，Samuels和她的团队分析了来自九名患者的17份转移性黑色素瘤肿瘤组织样本。他们获得了这些肿瘤的细菌基因组图谱，然后使用一种称为HLA肽组学（HLA peptidomics ）的方法来鉴定能够被免疫系统识别的肿瘤抗原肽。

HLA肽组学分析发现，黑色素瘤细胞表面有来自41种不同细菌的近300种肽。一项关键的新发现是，这些肽是由HLA蛋白复合物呈递在癌细胞表面上，其中HLA蛋白复合物存在于我们身体所有细胞的细胞膜上，并在调节免疫反应方面发挥作用。HLA的作用之一就是通过将外来肽 “呈递”给免疫系统，让免疫T细胞能够 “看到”它们，从而对任何外来事物发出警报。

论文共同第一作者Shelly Kalaora博士说，“利用HLA肽组学，我们能够以一种无偏见的方式揭示HLA呈递的肿瘤抗原肽。这种方法在过去已经使我们能够鉴定出在临床试验中表现出有希望的肿瘤抗原。”

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